档案销毁是保护机密信息的必要措施，需根据档案类型、数量和敏感度选择合适的方法，如物理销毁法、数据擦除法、热处理法和物理破坏法等。销毁过程需严格控制并记录，以确保信息不泄露且销毁工作有效。
热处理法：
热力处理：将档案放在高温高压设备中进行热解处理，使其变成灰烬。
化学处理：使用化学试剂进行高温化学处理，使档案中的纤维和墨迹彻底分解。
档案销毁方式：
档案可以送到指定造纸厂化成纸浆，这是销毁大批量纸质档案为常用的一种方式；数量少而又具有机密性的档案应当先用碎纸机打碎再作处理；以磁带磁盘、光盘等为载体的档案，可以采用物理删除、格式化或焚烧等方式销毁。无论采取何种方式进行销毁，都必须严格坚持两人以上监销的原则。监销结束，监销人员须在销毁清册上签字，并注明“已销毁”字样和销毁方式、销毁日期。已经销毁的科技档案，应在目录上注销,并对排列顺序进行相应调整。
经鉴定可以销毁的档案，应当按照以下程序销毁。
（一）机关档案部门编制档案销毁清册，列明拟销毁档案的档号、文号、责任者、题名、形成时间、应保管期限、已保管时间和销毁时间等内容，按档案工作协调机制报请审核批准；
（二）机关分管档案工作的单位负责人、办公厅（室）负责人、档案部门负责人、相关业务部门负责人、档案部门经办人、相关业务部门经办人在档案销毁清册上签署意见；
（三）机关档案部门组织档案销毁工作，并与相关业务部门共同派员监销。监销人在档案销毁前，应当按照档案销毁清册所列内容进行清点核对；在档案销毁后，应当在档案销毁清册上签名或盖章。销毁清册应当保存。