CRCC实行主任负责制，设有综合业务部、机车车辆事业部、基础设施事业部、城轨装备事业部和申诉监理部等5个专业部门以及相应的后勤保障部门。CRCC不以营利为目的，注重社会效益，实行有偿服务。其宗旨是：努力促进产品质量提高，确保运输，服务于绿色轨道交通。其质量方针是客观公正、科学准确、服务规范。

认证部亦以铁道部产品质量监督检验中心为基础，主要包括业务部、标准协调部、检查检验部、检验协调部和申诉监理部。综合后勤部和技术装备部为产品认证和产品检验提供技术装备保障和后勤服务。基础部以铁道部标准计量研究所为基础，主要包括：铁路行业标准化研究室、铁路专用计量室、国家轨道衡计量站、国家铁路罐车容积计量站。

CRCC业务部在收到申请方提交的申请书和相关材料后，进行初步审查，确认填写内容是否准确、相关材料是否齐全，若申请材料不全或填写不符合要求，应向申请方发送《申请材料补充通知书》。若申请方未能按要求在30天内补充/完善所需的材料并未作任何解释和说明，则认为申请方撤销本次申请。

申请方提交的申请书和相关材料齐备后，报送CRCC相关技术专家对供货经历进行评价、组织合同评审，并于10个工作日内做出是否受理申请的决定。对受理者，向申请方发出《受理铁路产品认证申请通知书》，对不受理者，书面通知申请企业，并说明理由。